こりんの基礎医学研究日記

都内の医大を2014年に卒業。現在は大学院で基礎研究中。日々の研究の中で疑問に思ったことや勉強したことなどを主に自分のための備忘録として書いていきいます。ときどき臨床の話や趣味の話も。必ずしも学術論文等が元となっていない内容もありますので、情報の二次利用の際はご注意ください。

公衆衛生

医師はがんスクリーニングに関する統計を正しく理解しているか? 

講義で習ったことのメモ。 医師はがんスクリーニングに関する統計を正しく理解しているか? ~PETによるがんスクリーニングは生存期間を延長させるか?~ Q. がん患者を集めた後ろ向きコホート研究でスクリーニングとしてPETを実施した群と実施しなかった群…

Clinical Effectiveness Research 比較効果研究

講義で習ったことのメモ。 Clinical Effectiveness Research 比較効果研究 米国国立アカデミー医学研究所(Institute of Medicine;IOM)は、CERを以下のように定義している。 CER とは,疾病の状態を予防,診断,治療,監視する,あるいは医療の提供を改善…

医学テータ統計解析に関するあれこれ Vo.3

大学院講義で学んだことのメモ。 医学研究デザインで大事なことは 1.ばらつきを小さくする!=Precisionをあげる …サンプルサイズ増やす、測定精度を上げる。 2.バイアスを小さくする!=Accuracyをあげる …サンプルサイズ増してもダメ。デザインの工夫が必…

決定木分析 Decision tree

講義で習ったことのメモ。 決定木分析 Decision tree 木の形の図を用いて分類や回帰、意思決定を行う方法。 はじめに1つの文献をご紹介。 Best M, Katamba A, Neuhauser D. Making the right decision: Benjamin Franklin's son dies of smallpox in 1736. Q…

医療統計:タモキシフェンと乳がん

医療統計にかんするセミナーのメモです。 タモキシフェンと乳がん 乳がん治療において術後の化学療法がしばしば行われる。 中でもホルモン剤の1つであるタモキシフェンは昔から用いられてきた。→タモキシフェンは乳がん再発を予防するか?Abe O. Breast Canc…

医学統計の結果の解釈

医療統計に関する大学院講義のメモです。 統計における結果の解釈 信頼区間の意味とは? 統計における結果の解釈 A市に住む多量飲酒者に肝硬変に関する注意喚起パンフレットを郵送。 肝硬変発症者は減少するか? 郵送群の肝硬変発症率は22% 非郵送群の肝硬変…

医学テータ統計解析に関するあれこれ Vo.2

医療統計に関する大学院講義のメモです。 大数の法則と中心極限定理 1.大数の法則 真値に収束する 大数の法則(たいすうのほうそく、英: Law of Large Numbers, LLN、仏: Loi des grands nombres[1])とは、確率論・統計学における基本定理の一つ。極限定理…

医学テータ統計解析に関するあれこれ Vo.1

医療統計に関する大学院講義のメモです。 医療統計の実際:ディオバン事件の問題点 Jikei Heart Study Mochizuki et al. Lancet 2007; 369: 1431-9 →のちに撤回 3000人程度の高血圧患者をディオバン群とほかの降圧薬群に分けて効果を検証。1次エンドポイント…

続・早産児の適切なSpO2目標は?~臨床試験の倫理的問題~

大学院講義で扱った論文のメモ。 以前こちらを投稿しました。 teicoplanin.hatenablog.com その続きみたいな感じです。関連文献紹介ですね。 まず、上記のもともとの文献を軽く振り返ります。 Abstract これまでの研究で、未熟児に高濃度酸素投与が行われる…

続・続・早産児の適切なSpO2目標は?~臨床試験の倫理的問題~

過去に書いた記事の補足 teicoplanin.hatenablog.com teicoplanin.hatenablog.com まずはStudyの概要振り返り。 以下は1本目の記事より引用。 Abstract これまでの研究で、未熟児に高濃度酸素投与が行われると未熟児網膜症が起きやすくなるとされてきたが、…

回帰分析に関するTips

勉強したことのメモです。 アウトカムとして生存or死亡など2値データを扱うとき→ロジスティック回帰 アウトカムとして入院日数などの連続量を扱うとき→線形回帰 ROC曲線を作成するとき、曲線の下の面積をArea under curve=AUCといい、判別能の高さを示す。 …

コホート研究のTipsいろいろ

公衆衛生セミナーで勉強したことの備忘録です。 例えば以下のようなClinical questionを持ったとする。 「妊娠中に貧血となる妊婦は早産になりやすいか?」 →これをどのように臨床研究で検証するか? まずRCTは困難である。患者を強制的に貧血にさせる、ある…

睡眠時血圧は心血管疾患発症に関与

調べる機会があったので調べたことのメモです。 Hermida RC, et al. Asleep blood pressure: significant prognostic marker of vascular risk and therapeutic target for prevention. Eur Heart J. 2018 Dec 14;39(47):4159-4171. 睡眠時血圧(Asleep blood…

RCTにおけるランダム化後の交絡因子・バイアス

講義で習ったことのメモ。 RCTにおけるランダム化後の交絡因子・バイアス 意識的なpost-randomization biases 無意識的なpost-randomization biases RCTにおけるランダム化後の交絡因子・バイアス これはあんまり意識したことはありませんでした。なんとなく…

ランダム化比較試験(RCT)に関するTipsいろいろ

自分がうけたレクチャーのメモです。 ランダム化比較試験(RCT) ランダム化の仕方 コンプライアンス プラセボの効果 Intention-to-treat解析(ITT解析) RCTのいろいろ ランダム化比較試験(RCT) 臨床研究の中でも介入研究に属する。(介入研究と観察研究がある。…

公衆衛生レクチャーで学んだこと⑬~統計に関するTips~

公衆衛生に関するレクチャーを受けました。それで新たに学んだこと、よくわからなくて後で調べたことなどをメモ的に書いていきます。 Population(母集団)とSample(サンプル)の違い 変数の種類 Countinuous variables (連続変数):年齢、慎重、体重 Dichotomo…

誤分類バイアス

本日は誤分類バイアスについてです。誤分類バイアスは「differential misclassification=差異的誤分類」と「non-differential misclassification=非差異的誤分類」の2つがある。 誤分類=misclassificationが起こるのことを指しているのはどちらも同じ。例え…

Immortal time bias 不死時間バイアス

勉強したことのメモです。以下の論文にimmortal time biasなるものが出てきました。 Filion KB, et al. Sodium glucose cotransporter 2 inhibitors and risk of major adverse cardiovascular events: multi-database retrospective cohort study. BMJ. 202…

公衆衛生レクチャーで学んだこと⑫~疫学に関するさまざまな用語の解説~

公衆衛生に関するレクチャーを受けました。それで新たに学んだこと、よくわからなくて後で調べたことなどをメモ的に書いていきます。 Prevalence=有病率 疾患を有している割合を示す。A point in timeの測定。疾患以外にも、例えば喫煙や抗血栓薬の内服のよ…

公衆衛生レクチャーで学んだこと⑪~さまざまな臨床研究の際のTips~

公衆衛生に関するレクチャーを受けました。それで新たに学んだこと、よくわからなくて後で調べたことなどをメモ的に書いていきます。 一部は過去記事と重複。 teicoplanin.hatenablog.com Cross-sectional study・・・横断研究と同じ。One pointのみの評価。Tim…

公衆衛生レクチャーで学んだこと⑩~交絡因子の調整について〜

公衆衛生に関するレクチャーを受けました。それで新たに学んだこと、よくわからなくて後で調べたことなどをメモ的に書いていきます。 交絡因子の調整について 交絡因子とは?…本来は関係ないのに結果に影響を与える因子。 よく例に出されるのは、飲酒と喫煙…

公衆衛生レクチャーで学んだこと⑨~回帰について〜

公衆衛生に関するレクチャーを受けました。それで新たに学んだこと、よくわからなくて後で調べたことなどをメモ的に書いていきます。 この回は難しかったのできちんとまとめられるか不安ですが・・・がんばってやっていきます。 「回帰」とは?~線形回帰~ ロ…

公衆衛生レクチャーで学んだこと⑧~COIと出版バイアスについて〜

公衆衛生に関するレクチャーを受けました。それで新たに学んだこと、よくわからなくて後で調べたことなどをメモ的に書いていきます。 COIについて 出版バイアスについて COIについて Boyle RJ, et al. Hydrolysed formula and risk of allergic or autoimmun…

公衆衛生レクチャーで学んだこと⑦~優越性試験・同等性試験・非劣性試験〜

公衆衛生に関するレクチャーを受けました。それで新たに学んだこと、よくわからなくて後で調べたことなどをメモ的に書いていきます。 優越性試験・同等性試験・非劣性試験 通常のランダム化比較試験=RCTは優越性試験として組まれていることが多い。 例えば、…

公衆衛生レクチャーで学んだこと⑥~臨床研究を組むステップ〜

公衆衛生に関するレクチャーを受けました。それで新たに学んだこと、よくわからなくて後で調べたことなどをメモ的に書いていきます。 ①帰無仮説を設定する。 ②対立仮説を設定する。 ③αを設定する。 α= probability of Type I Error 有意水準のこと。多くの場…

公衆衛生レクチャーで学んだこと⑤~研究デザインの組み方~

公衆衛生に関するレクチャーを受けました。それで新たに学んだこと、よくわからなくて後で調べたことなどをメモ的に書いていきます。 さまざまな研究デザインの組み方・特徴 Cross-sectional study 横断研究 Case control study ケースコントロール研究 Pros…

公衆衛生レクチャーで学んだこと④~疫学入門・臨床研究の種類~

公衆衛生に関するレクチャーを受けました。それで新たに学んだこと、よくわからなくて後で調べたことなどをメモ的に書いていきます。 疫学入門・臨床研究の種類 ①Cross-sectional study 横断研究 ②Ecological study 生態学的研究 ③Case control study ④Prosp…

公衆衛生レクチャーで学んだこと③~リスク比とオッズ比~

公衆衛生に関するレクチャーを受けました。それで新たに学んだこと、よくわからなくて後で調べたことなどをメモ的に書いていきます。 オッズ比とリスク比 100人の肺がん患者と100人の肺がんでない患者を集めた。 このとき、リスク比:9 オッズ比:81 リスク…

公衆衛生レクチャーで学んだこと②~サンプルサイズの計算~

公衆衛生に関するレクチャーを受けました。それで新たに学んだこと、よくわからなくて後で調べたことなどをメモ的に書いていきます。 サンプルサイズの計算 これは2群で比較する際のサンプルサイズの計算式です。 ※サンプルサイズの計算は推測に過ぎないこと…

公衆衛生レクチャーで学んだこと①~罹患率は1を超えることもある~

公衆衛生に関するレクチャーを受けました。それで新たに学んだこと、よくわからなくて後で調べたことなどをメモ的に書いていきます。 罹患率=Incidenceは1を超えることもある Prevalence=有病率はある1点のおいて疾患を有している人の割合。 これに対してInc…